《废柴风纪委员与裙子长度不合规的JK的故事》是一部校园青春题材的轻喜剧，讲述了风纪委员与一位裙子长度不符合校规的女生之间发生的一系列趣味冲突与成长故事。影片以现代日本某高中为背景，展现了校园生活中的纪律与自由之间的矛盾，以及个性与规矩的碰撞。

故事的主人公是学校风纪委员小林真纪，一个虽然认真但常被同学戏称为“废柴”的女孩。她极力维护学校的规章制度，却总因手忙脚乱和粗心大意而陷入尴尬境地。相对的，另一个核心角色是转校生铃木美咲，她以独特的穿着风格和超短裙引发校园风纪风波，两人因此擦出激烈火花。

剧情围绕着真纪试图说服美咲遵守裙子长度规定展开，过程中二人从对立到理解，逐渐建立起微妙的友谊。故事的高潮发生在一次校内风纪大检查中，两人联手解决了因裙子风波引发的误会和矛盾，赢得了同学和老师的认可。最终，真纪不仅成长为更加自信和坚强的风纪委员，美咲也学会了尊重规则与自我表达的平衡，影片以温馨和谐的校园生活画面作结。